مطالعه تنوع ژنتیکی xanthomonas oryzae pv. oryzae در مزارع برنج استان گیلان با استفاده از نشانگرهای rapd

تنوع ژنتیکی 60 جدایه از xanthomonas oryzae pv. oryzae ، عامل بیماری بلایت باکتریایی برنج، جمع آوری شده از مزارع برنج استان گیلان، با استفاده از نشانگر rapd مورد ارزیابی قرار گرفت. سه جمعیت مد نظر قرار داده شدند: جدایه های جمع آوری شده از خزانه، جدایه های جمع آوری شده از مزرعه و جدایه های جمع آوری شده از خوشه. هشت آغازگر به کار گرفته شده در مجموع، 187 نوار چند شکل ایجاد کردند. بزرگترین قطعه توسط آغازگر 80.7 و کوچکترین قطعه توسط آغازگر opk07 تکثیر شد. کمترین محتوای اطلاعات چند شکلی مربوط به آغازگر opa12 (36/0) و بیشترین مقدار آن مربوط به آغازگر opa10 (44/0) بود. تجزیه واریانس مولکولی داده های rapd نشان داد که تفاوت ژنتیکی درون جمعیتی نسبت به تفاوت بین جمعیت ها بیشتر بود. تجزیه خوشه ای به روش upgma و با استفاده از ضریب تشابه تطابق ساده انجام شد. در سطح تشابه 6/0 جدایه ها به سه گروه مجزا تقسیم شدند. گروه اول، تنها شامل جدایه های خزانه، گروه دوم، تنها شامل جدایه های مزرعه و گروه سوم شامل مجموعه ای از جدایه های خزانه، مزرعه و خوشه بود. نتایج حاصل از این بررسی نشان داد که آغازگرهای rapd به کار گرفته شده در این بررسی، قادر به تمایز جدایه های خزانه و مزرعه از یکدیگر بودند.